Die Schienenstränge im Ostteil des Bahnhofs Friedrichstraße sind abgebaut. Ein Zug der Stadtbahn der Linie B3 in Richtung Erkner steht im S-Bahnhof. Dieser Teil des Bahnhofs diente als Kopfstation für die Züge in Richtung Osten nach Erkner, Königs Wusterhausen, Strausberg Nord, Ahrensfelde, Wartenberg und zum Flughafen Schönefeld. Hier war der Bahnhof massiv gegen Grenzdurchbrüche gesichert, wie beispielweise mit der hier zu sehenden hallenhohen Trennwand, die den Teil des Bahnhofs mit den Fernzügen von dem Teil mit Zügen der innerstädtischen Stadtbahn trennt.